Acerca de este Curso

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This course distills for you expert knowledge and skills mastered by professionals in Health Big Data Science and Bioinformatics. You will learn exciting facts about the human body biology and chemistry, genetics, and medicine that will be intertwined with the science of Big Data and skills to harness the avalanche of data openly available at your fingertips and which we are just starting to make sense of. We’ll investigate the different steps required to master Big Data analytics on real datasets, including Next Generation Sequencing data, in a healthcare and biological context, from preparing data for analysis to completing the analysis, interpreting the results, visualizing them, and sharing the results.
Needless to say, when you master these high-demand skills, you will be well positioned to apply for or move to positions in biomedical data analytics and bioinformatics. No matter what your skill levels are in biomedical or technical areas, you will gain highly valuable new or sharpened skills that will make you stand-out as a professional and want to dive even deeper in biomedical Big Data. It is my hope that this course will spark your interest in the vast possibilities offered by publicly available Big Data to better understand, prevent, and treat diseases.

Fechas límite flexibles

Restablece las fechas límite en función de tus horarios.

Certificado para compartir

Obtén un certificado al finalizar

100 % en línea

Comienza de inmediato y aprende a tu propio ritmo.

Nivel avanzado

Aprox. 40 horas para completar

Inglés (English)

Habilidades que obtendrás

Bioinformatics
Data Clustering Algorithms
Big Data
R Programming

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Certificado para compartir

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100 % en línea

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Nivel avanzado

Aprox. 40 horas para completar

Inglés (English)

Instructor

Calificación del instructor

4,38/5 (50 calificaciones)

Isabelle Bichindaritz

Programa - Qué aprenderás en este curso

Calificación del contenido90%(2,109 calificaciones)

Semana

1

Semana 1

4 horas para completar

Genes and Data

4 horas para completar

11 videos (Total 59 minutos), 2 lecturas, 6 cuestionarios

11 videos

Introduction to the Course1m

Introduction to Module1m

DNA and Genes9m

RNA and Proteins6m

Transcription Process4m

Transcription Animation1m

Translation Process5m

Translation Animation2m

Data, Variables, and Big Datasets6m

Working with cBioPortal - Genetic Data Analysis9m

Working with cBioPortal - Gene Networks9m

2 lecturas

Module 1 cBioPortal Data Analytics10m

Module 1 Resources10m

6 ejercicios de práctica

DNA, RNA, Genes, and Proteins30m

Transcription and Translation Processes30m

Data, Variables, and Big Datasets30m

Working with cBioPortal30m

Module 1 Quiz30m

Module 1 cBioPortal Data Analytics30m

Semana

2

Semana 2

8 horas para completar

Preparing Datasets for Analysis

8 horas para completar

13 videos (Total 75 minutos), 4 lecturas, 8 cuestionarios

13 videos

Introduction to Module4m

Datasets and Files10m

Data Sources11m

Importance of Data Preprocessing4m

Data Preprocessing Tasks2m

Replacing Missing Values3m

Data Normalization9m

Data Discretization5m

Feature Selection3m

Data Sampling2m

Principles of R6m

R Language1m

Jupyter Notebooks 1017m

4 lecturas

Jupyter Notebooks Essentials10m

Notebook Module 2 Tutorial10m

Module 2 R Data Preprocessing10m

Module 2 Resources10m

8 ejercicios de práctica

Datasets and Files30m

Data Preprocessing Tasks30m

Replacing Missing Values30m

Normalization and Discretization30m

Data Reduction30m

Working with R30m

Module 2 Quiz30m

Module 2 R Data Preprocessing30m

Semana

3

Semana 3

7 horas para completar

Finding Differentially Expressed Genes

7 horas para completar

9 videos (Total 53 minutos), 4 lecturas, 6 cuestionarios

9 videos

Introduction to Module2m

Overview of Feature Selection Methods13m

Filter Methods4m

Wrapper Methods4m

Evaluation Schemes7m

Selecting Differentially Expressed Genes3m

Heatmaps6m

R Scripts for Feature Selection3m

Jupyter Notebooks 1017m

4 lecturas

Notebook Module 3 Tutorial10m

Jupyter Notebooks Essentials10m

Module 3 R Finding Differentially Expressed Genes10m

Module 3 Resources10m

6 ejercicios de práctica

Feature Selection Methods30m

Evaluation Schemes30m

Differentially Expressed Genes30m

Heatmaps30m

Module 3 Quiz30m

Module 3 R Finding Differentially Expressed Genes30m

Semana

4

Semana 4

8 horas para completar

Predicting Diseases from Genes

8 horas para completar

12 videos (Total 85 minutos), 4 lecturas, 10 cuestionarios

12 videos

Introduction to Module9s

Overview of Classification and Prediction Methods8m

Classification Methods Based on Analogy12m

Classification Methods Based on Rules13m

Classification Methods Based on Neural Networks7m

Classification Methods Based on Statistics3m

Classification Methods Based on Probabilities7m

Prediction Methods4m

Evaluation Schemes13m

Prediction Workflow4m

R Scripts for Prediction1m

Jupyter Notebooks 1017m

4 lecturas

Jupyter Notebooks Essentials10m

Notebook Module 4 Tutorial10m

Module 4 R Predicting Diseases from Genes10m

Module 4 Resources10m

10 ejercicios de práctica

Overview30m

Classification with Analogy30m

Classification based on Rules30m

Classification with Neural Networks30m

Classification based on Statistics30m

Classification based on Probabilities30m

Prediction Models30m

Evaluation Schemes30m

Module 4 Quiz30m

Module 4 R Predicting Diseases from Genes30m

Semana

5

Semana 5

7 horas para completar

Determining Gene Alterations

After this module, you will be able to

1. List different types of gene alterations. 2. Compare and contrast methods for detecting gene mutations. 3. Compare and contrast methods for detecting methylation. 4. Compare and contrast methods for detecting copy number variations. 5. Quantify genomic alterations. 6. Connect genomic alterations to differential expression of genes. 7. Write programs in R for determining gene alterations and their relationship with gene expression.

7 horas para completar

9 videos (Total 81 minutos), 4 lecturas, 8 cuestionarios

9 videos

Introduction to Module1m

Overview of Gene Alterations16m

Genetic Mutations9m

Finding Genetic Mutations7m

Methylation8m

Copy Number Alterations10m

Genomic Alterations and Gene Expressions16m

R Scripts for Gene Alterations1m

Jupyter Notebooks 1017m

4 lecturas

Notebook Module 5 Tutorial10m

Jupyter Notebooks Essentials10m

Module 5 R Gene Alterations10m

Module 5 Resources10m

8 ejercicios de práctica

Gene Alterations30m

Gene Mutations30m

Methylation30m

Copy Number Alterations30m

Genomic Alterations and Gene Expressions30m

Module 5 Quiz (Temporary)30m

Module 5 Quiz30m

Module 5 R Gene Alterations30m

Semana

6

Semana 6

6 horas para completar

Clustering and Pathway Analysis

6 horas para completar

12 videos (Total 73 minutos), 5 lecturas, 5 cuestionarios

12 videos

Introduction to Module2m

Overview of Clustering Methods7m

Similarity Assessment8m

Clustering with KMeans7m

Density Based Clustering4m

Hierarchical Clustering6m

Pathway Analysis12m

Pathway Discovery7m

Pathway Visualization6m

R Scripts for Clustering and Pathway Analysis1m

Jupyter Notebooks 1017m

Concluding Remarks1m

5 lecturas

Jupyter Notebooks Essentials10m

Notebook Module 6 Tutorial10m

Module 6 R Clustering and Pathways10m

Module 6 Resources10m

Acknowledgements10m

5 ejercicios de práctica

Clustering30m

Clustering Methods30m

Pathways30m

Module 6 Quiz30m

Module 6 R Clustering and Pathways30m

Reseñas

4.2

86 reseña

5 stars
54,33 %
4 stars
29,13 %
3 stars
8,66 %
2 stars
2,36 %
1 star
5,51 %

Principales reseñas sobre BIG DATA, GENES, AND MEDICINE

por SB22 de jun. de 2020

The course is more of an intermediate course than an advanced one, but a great starting point from where you can find your own interests and develop further on that.

por HH6 de mar. de 2017

The course is amazing, I want to purchase the course but it is not being working...I don't know what is the problem.

por AM28 de nov. de 2018

Should have focused more on the coding part. Rest of the course was informative and well structured.

por HH24 de ago. de 2020

This course gives me a idea about my project.very informative course.thank you

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Preguntas Frecuentes

¿Cuándo podré acceder a las lecciones y tareas?
El acceso a las clases y las asignaciones depende del tipo de inscripción que tengas. Si tomas un curso en modo de oyente, verás la mayoría de los materiales del curso en forma gratuita. Para acceder a asignaciones calificadas y obtener un certificado, deberás comprar la experiencia de Certificado, ya sea durante o después de participar como oyente. Si no ves la opción de oyente:
es posible que el curso no ofrezca la opción de participar como oyente. En cambio, puedes intentar con una Prueba gratis o postularte para recibir ayuda económica.
Es posible que el curso ofrezca la opción 'Curso completo, sin certificado'. Esta opción te permite ver todos los materiales del curso, enviar las evaluaciones requeridas y obtener una calificación final. También significa que no podrás comprar una experiencia de Certificado.
¿Qué recibiré si compro el Certificado?
Cuando compras un Certificado, obtienes acceso a todos los materiales del curso, incluidas las tareas calificadas. Una vez que completes el curso, se añadirá tu Certificado electrónico a la página Logros. Desde allí, puedes imprimir tu Certificado o añadirlo a tu perfil de LinkedIn. Si solo quieres leer y visualizar el contenido del curso, puedes participar del curso como oyente sin costo.
¿Hay ayuda económica disponible?
Sí. En ciertos programas de aprendizaje, puedes postularte para recibir ayuda económica o una beca en caso de no poder costear los gastos de la tarifa de inscripción. Si hay ayuda económica o becas disponibles para tu selección de programa de aprendizaje, verás un enlace para postularte en la página de descripción.

¿Tienes más preguntas? Visita el Centro de Ayuda al Estudiante.

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