4.4
estrellas
31 calificaciones

Todd Edwards +1 instructores más

3235 ya inscrito

Ofrecido Por

Genetic Epidemiology Foundations

Sistema Universitario de Colorado

Acerca de este Curso

8375 vistas recientes

This course is presented by the University of Colorado Denver in collaboration with the Vanderbilt Genetics Institute at Vanderbilt University Medical Center and the International Genetic Epidemiology Society. It is designed to provide students with the background and knowledge foundations necessary to conduct statistical analysis of genetic association study data. This course includes multiple lectures and evaluations on each of the topics: the history of genetics research presented by Dr. Nancy Cox, foundational concepts in population genetics presented by Dr. Bruce Weir, population structure in genetic association studies presented by Dr. Todd Edwards, quality control in genetic studies presented by Dr. Goncalo Abecasis, analysis of population-based case-control association studies presented by Dr. Celia Greenwood, and analysis of family-based studies presented by Dr. Joan Bailey-Wilson. Examples of concepts and reference literature are also provided in this 6-module course.

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Instructores

Calificación del instructor

4,69/5 (16 calificaciones)

Todd Edwards

Ph.D.

3235 alumnos

1 curso

Stephanie A. Santorico

Ph.D.

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Programa - Qué aprenderás en este curso

Semana

Semana 1

3 horas para completar

What is Genetic Epidemiology? Historical Perspective and Introduction

3 horas para completar

11 videos (Total 69 minutos), 3 lecturas, 1 cuestionario

11 videos

Course Introduction2m

Module 1 Introduction: What is Genetic Epidemiology?53s

Origins of Genetic Epidemiology8m

Legacies of these Origins and Scientific Rigor7m

Liability and Threshold Models: Introduction6m

Testing and an Example2m

Genetic Regulation of Gene Expression9m

Introduction3m

Methods8m

Methods Continued and Extension8m

Pleiotropy9m

3 lecturas

Acknowledgements and Instructors10m

Glossary10m

References and Links10m

1 ejercicio de práctica

Module 1 Summative Assessment45m

Semana

Semana 2

3 horas para completar

Introduction to Population Genetics: Models and Assumptions

3 horas para completar

16 videos (Total 115 minutos), 1 lectura, 1 cuestionario

16 videos

Introduction to Population Genetics44s

Hardy-Weinberg Equilibrium Definition and Implications9m

HWE Testing and P-Values9m

HWE Testing Power, QQ Plots, and Multiple Tests5m

HW Departures and Population Structure8m

Genetic Drift I7m

Genetic Drift II7m

Population Structure I9m

Population Structure II7m

Inbreeding and Relatedness I9m

Inbreeding and Relatedness II8m

Inbreeding and Relatedness III7m

Linkage Disquilibrium I6m

Linkage Disquilibrium II6m

Linkage Disquilibrium III6m

Linkage Disquilibrium IV5m

1 lectura

Population Structure and Genetic Association Studies

Taught by Dr. Todd Edwards, Vanderbilt University Medical Center. Building from the introduction to population genetics, in this module you will learn processes that lead to genetic differences between populations, methods to characterize these differences, and how to conduct association studies in structured populations. In addition, you will be able to describe how admixture methods can be applied for association mapping.

3 horas para completar

12 videos (Total 66 minutos), 2 lecturas, 1 cuestionario

12 videos

Population Structure1m

Definition of Population Structure and Brief Overview of Human History6m

Factors the Influence Population Structure and Genetic Drift7m

Natural Selection8m

Examples of Population Structure in Modern Humans8m

Pima Example4m

Statistical Methods I: Structured Association and Genomic Control5m

Statistical Methods II: Principal Components Analysis5m

Statistical Methods III: LD Score Regression3m

Statistical Methods IV: Principal Components4m

Statistical Methods V: Mixed Models3m

Statistical Methods VI: Admixture Mapping6m

2 lecturas

Resources Part 110m

Resources Part 210m

1 ejercicio de práctica

Module 3 Summative Assessment1h

Semana

Semana 4

2 horas para completar

Basic Quality Control in Genetic Data: Data Structure

Taught by Dr. Gonçalo Abecasis, University of Michigan and Regeneron, Inc. Quality control is an important step for high throughput genotype data. In this module, you will learn a range of different approaches to identify and to deal with quality problems at different stages of the analysis. In addition, genotype imputation is introduced to infer genotypes at markers that were not typed in the study samples.

2 horas para completar

11 videos (Total 60 minutos), 1 lectura, 1 cuestionario

11 videos

Basic Quality Control in Genetic Data1m

Motivation and Background6m

Introduction to Quality Control6m

QQplots: Part 14m

QQplots: Part 25m

Mendelian Inconsistency Checks7m

Population Structure: Part 14m

Population Structure: Part 25m

Genotype Imputation: Introduction5m

Genotype Imputation: The Details, Part 14m

Genotype Imputation: The Details, Part 27m

1 lectura

Optional Readings10m

1 ejercicio de práctica

Module 4 Summative Assessment1h

Semana

Semana 5

3 horas para completar

Population-Based Association Studies

Taught by Dr. Celia Greenwood, McGill University. Population based association studies have played an important role in mapping genes and genomic regions for complex traits by detecting association between alleles and a trait. In this module, you will learn basic measures of association, common modeling strategies, how to adjust for multiple testing and why, how to evaluate association results, and how to increase reproducibility of study results, including the use of meta-analysis and genetic imputation.

3 horas para completar

14 videos (Total 71 minutos), 1 lectura, 1 cuestionario

14 videos

Population-Based Association Studies1m

Basic Measures: Part 14m

Basic Measures: Part 27m

Common Modeling Strategies: Part 15m

Common Modeling Strategies: Part 25m

Introduction to Multiple Testing: Part 15m

Introduction to Multiple Testing: Part 26m

Reproducibility: Part 15m

Reproducibility: Part 26m

Introduction to Genotype Imputation: Part 15m

Introduction to Genotype Imputation: Part 23m

Introduction to Meta-Analysis and Consortia: Part 14m

Introduction to Meta-Analysis and Consortia: Part 24m

Introduction to Meta-Analysis and Consortia: Part 34m

1 lectura

Resources10m

1 ejercicio de práctica

Module 5 Summative Assessment1h

Semana

Semana 6

3 horas para completar

Family-Based Designs

Taught by Dr. Joan Bailey Wilson, National Human Genome Research Institute, National Institutes of Health. In this module, you will learn about the various ways in which family-based collections of genetic data are utilized in Genetic Epidemiology. This includes methods that provide support that a genetic component to a trait exists as well as to identify modes of inheritance consistent with a set of data. In addition, linkage methods, which identify large regions of the genome, and association methods, which identify a smaller set of variants, are covered to understand genetic factors affecting a trait.

3 horas para completar

18 videos (Total 107 minutos), 1 lectura, 1 cuestionario

Reseñas

4.4

6 reseña

5 stars
64,51 %
4 stars
22,58 %
3 stars
3,22 %
2 stars
3,22 %
1 star
6,45 %

Principales reseñas sobre GENETIC EPIDEMIOLOGY FOUNDATIONS

por JB27 de nov. de 2022

Excellent introductory lectures. I learned alternative ways of presenting this material and corrected some details from self study.

por NN26 de jun. de 2022

Perfect course, full of all the necessary information. Thanks a lot to all instructors.

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Preguntas Frecuentes

¿Cuándo podré acceder a las lecciones y tareas?
El acceso a las clases y las asignaciones depende del tipo de inscripción que tengas. Si tomas un curso en modo de oyente, verás la mayoría de los materiales del curso en forma gratuita. Para acceder a asignaciones calificadas y obtener un certificado, deberás comprar la experiencia de Certificado, ya sea durante o después de participar como oyente. Si no ves la opción de oyente:
es posible que el curso no ofrezca la opción de participar como oyente. En cambio, puedes intentar con una Prueba gratis o postularte para recibir ayuda económica.
Es posible que el curso ofrezca la opción 'Curso completo, sin certificado'. Esta opción te permite ver todos los materiales del curso, enviar las evaluaciones requeridas y obtener una calificación final. También significa que no podrás comprar una experiencia de Certificado.
¿Qué recibiré si compro el Certificado?
Cuando compras un Certificado, obtienes acceso a todos los materiales del curso, incluidas las tareas calificadas. Una vez que completes el curso, se añadirá tu Certificado electrónico a la página Logros. Desde allí, puedes imprimir tu Certificado o añadirlo a tu perfil de LinkedIn. Si solo quieres leer y visualizar el contenido del curso, puedes participar del curso como oyente sin costo.
¿Hay ayuda económica disponible?
Sí. En ciertos programas de aprendizaje, puedes postularte para recibir ayuda económica o una beca en caso de no poder costear los gastos de la tarifa de inscripción. Si hay ayuda económica o becas disponibles para tu selección de programa de aprendizaje, verás un enlace para postularte en la página de descripción.

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